كيف تكون هيكل دوائي معقد التركيب من أجزاء كيميائية بسيطة غير مرتبة؟
تماما مثل ترتيب قطع ال puzzle جنبا الى جنب لتكوين صورة متكامله لها معنى، فقد اصبح من الممكن تجميع قطع كيميائية صغيرة غير فعالة بيولوجيا و تحويلها الى مركب أكثر تعقيدا له فاعلية ضد الهدف البيولوجي الذي تم تحديده.
تسمى هذه الطريقة بتصميم الادوية المبني على الشظايا (Fragment-based Drug Design; FBDD).
فباستخدام الهيكل الفراغي للموقع النشط للبروتين المستهدف كقالب، يتم تكوين مركب دوائي من خلال تجميع مجموعات كيميائية صغيرة (شظايا أو Fragments) بحيث تكون هذه المجموعات متكاملة في الشكل الفراغي مع قالب الموقع النشط، و بالتالي يصبح المركب الكيميائي النهائي بعد ترابط هذه الأجزاء له قابلية عالية (Affinity) للارتباط بالموقع النشط للبروتين المستهدف.
مؤخرا، قمنا يتطوير هذه الطريقة بجعل الموقع النشط هو من يختار الاجزاء الكيميائية المكملة له من خلال تعريضه لعدة تجارب من المحاكاة الجزيئية الطويلة، ومن ثم قمنا بتحليل ارتباط المجموعات الكيميائية الصغيرة (Fragments) لتشكيل خريطة هيكلية افتراضية للهيكل المطلوب تصميمه ليصبح دواءا محتملا قادرا على الارتباط بالبروتين المستهدف. أطلقنا على هذه الطريقة اسم “تصميم الأدوية الديناميكي المعتمد على الشظايا” أو “Dynamic Fragment-based Drug Design; DFBDD”.
نأمل في المستقبل القريب أن نستطيع تطوير هذا الاسلوب في تصميم أدوية أكثر انتقائية و بالتالي أكثر أمانا.
دمتم بخير!
رابط البحث المنشور: